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七点整日军的友永丈市大尉率第一攻击波机群准备开始返航，并向南云忠一发出了需要进行第二次攻击的电报；
可就在随后几分钟，米军的大黄蜂号及企业号上由战斗机、鱼雷机、俯冲轰炸机所组成的一百一十七架战机，从斯普鲁恩斯少将所率领的第十六特混编队升空，奔向二百海里外的南云舰队。
“报告指挥官，米军的航母舰载机已经全部起飞，我们是不是即将展开攻击？”被临时剥夺了舰长职务当起徐飞传令兵的大肚鱼舰长拿着不断收集的情报报告道。
“按照开始设定，两艘隐形潜艇进攻巨型战列舰和大型战列舰，大白鲨二型进攻其余的战列舰和航母，中型攻击航母打击米军的巡洋舰和驱逐舰；
我们的单人潜艇即刻出发对付他们的潜艇去，接下来这艘潜艇归你指挥，我去弄一架单人潜艇试一下战斗力。”徐飞回头示意道。
米军为了打日军一个措手不及，这次将舰队全部弄到了中途岛两百多公里外，虽说隐蔽性强了许多，不过单凭那些战机对付大和级战列舰根本就不可能；
这小日本和灭日军鲲鹏号打了两次大海战别的没学到，可密集防空阵型他们倒是学的不差，在大和号上枝枝丫丫的到处都是防空火力，为的就是他们敢确认密集防空阵下，他们的高速战机零式也无法突破进来。
米军的战机可没有经受过密集防空网的攻击，当首批从中途岛起飞的十架美军鱼雷轰炸机出现在南云舰队的上空。
美军飞机排成单行，扑向日航空母舰，在日军战斗机的截杀和日军的大和级东京号猛烈的防空炮火下，很快就被击落了七架。
永友文市海军大尉报告和中途岛美机的攻击，使南云中将相信中途岛的防御力量还很强，于是决定把原来准备用于对付美舰的飞机改为对中途岛进行第二次轰炸，直到此时，他仍然没有发现美军舰队。
徐飞进入一个单人潜艇之类。这种潜艇他后世没有听说过，只有七米长的长度，高宽不过两米多，一台由电池带动的电动机驱动两组螺旋桨。正常挂配是两枚六米对舰或者四枚四米的对潜艇鱼雷，这次所有的单人潜艇就是挂装了对潜鱼雷。
徐飞对这些由科研所搞出来的特殊装备一向兴趣饱满，所以每一种装备他都无比地熟悉，就像这样的单人潜艇，上面除了一个单人驾驶舱，其余部位全部是充好电的电池组；
只有三百海里巡航距离只能适用于突袭，要是装备上氦三电池组便可以在大海上远距离突袭，不过徐飞觉得没有必要这才没有弄在这个上面；
驾驶舱中显得简约而不简单，一台小型的声纳探测仪，可以侦查到十海里内的潜艇与战舰。一台自动声纹识别器，有数据模块将采集到的各种潜艇和战舰声纹输入进去，只要听到声音，显示器上就会表明距离深度和对方的型号；
驾驶舵上的四个红色按钮就是鱼雷发射器，驾驶舱突出于艇身半米左右。前后有着两个大灯可以对海照耀，也就是说，除了声纳反馈信号识别，这种单人潜艇还可以进行肉眼观察。
此时米军的战舰距离灭日军潜艇部队有五十海里，在米军舰队周围有着数量不少的潜艇护卫，要进行突袭就得避开这些米军的潜艇部队。
在潜艇部队开始向米军舰队接近时，日军方面却变得出奇的混乱。南云忠一因为接到中途岛的报告，下令赤城号和加贺号将在甲板上已经装好鱼雷的飞机送下机库，卸下鱼雷换装对地攻击的高爆炸弹。
过了不久南云又接到利根号推迟半小时起飞的一架侦察机发来的电报，距中途岛约二百四十海里的海面发现十艘艘美国军舰；
南云命该侦察机继续查明敌人舰队是否拥有航空母舰，同时命令暂停对鱼雷机的换弹。就在南云等待侦察机的侦察结果时，空中再次响起了警报。
四十余架从中途岛起飞的美军b-17轰炸机和俯冲轰炸机扑向南云的舰队。由于美军的轰炸机没有战斗机护航，结果很快的就被南云派出的零式战斗机击退。
南云终于接到了侦察机传来的报告，美军舰队里确实有航母的存在，南云下令各舰停止装炸弹，飞机再次送回机库重新改装鱼雷。日本航空母舰的甲板上一片混乱，为了争取时间，刚从飞机上卸下的炸弹，都堆放在甲板上。
空袭中途岛的第一攻击波机群返航飞抵日本舰队的上空，还有那些保护航空母舰的战斗机也需要降落加油。
南云处于进退维谷的境地，第二航空母舰战队司令山口海军少将向南云建议立即命令攻击部队起飞。
第二批突击飞机换装鱼雷还没有完成，如果马上发动进攻，也没有战斗机护航，而且舰上的跑道被起飞的飞机占用，那么油箱空空的第一攻击波机群会掉进海里；
南云决定把攻击时间推迟，首先收回空袭中途岛和拦截美军轰炸机的飞机，然后重新组织部队以进攻美军特混舰队。
南云忠一是一个老海军，照理说指挥这样的战斗不会出现这种凌乱不堪的情况；
如果他选择让甲板上的飞机离开进攻中途岛，换上回航的飞机挂装鱼雷进攻米军的联合舰队，那正常的结局就该是两败俱伤，可惜规则便是他
该倒霉，聪明一世的南云忠一却在此时糊涂了一会。
如果说按照正常的历史衍生，日军将会在这一个个不应该出现的叉子中最终被打得一片混乱，最终损失惨重；
不过这次多出了九艘不该出现在战场上的潜艇，让故事从米军弗莱彻少将率领的第十七特遣舰队的约克镇号航空母舰上起飞了三十五架战机后开始变形。
米军的战舰足足有百多艘就在相距只有数十海里范围内布置着阵型，他们原本准备以突袭日军航母之后，让巨型战列舰和大型战列舰带着老式战列舰和重巡出击；
在周围他们依旧严防着日军的潜艇偷袭，这也是珍珠港战役中企业号等战舰遭受埋伏后米军做的防御准备。